Бобровский Д. М. Анализ транскриптомных данных Лекция 13. Определение траекторий дифференцировки

Определение траекторий дифференцировки клеток в scRNAseq 00:00:19 Постановка задачи и подзадач 00:14:02 Восстановление кривой: polygonal reconstruction 00:18:41 Monocle, Monocle2 и GAM 00:40:17 Recerved graph embedding 00:51:15 Diffusion maps 01:09:34 Paga и DPT 01:15:07 Monocle3 01:20:45 Palantir 01:30:38 RNA velocity 01:44:00 Cellbank и CytoTRACE Ссылка на плейлист: